深沪湾独特的自然条件吸引许多鸟类在此安营扎寨或安家落户。为了掌握深沪湾保护区鸟类资源状况和区系物征，保护区管理处组织技术人员开展每月至少1次，持续一整年的监测调查活动。调查活动采用样线监测和高位定点统计相结合方法，对鸟类种类、种群、数量、珍稀物种种类和栖息状况等多样性内容和指标进行监测。

经过一年多的监测调查，深沪湾保护区记录到鸟类15目35科106种，约占全国鸟类总科目数的57.69%，占全国鸟类种数的7.18%，占泉州市鸟类种数的34.53%。调查发现保护区以越冬候鸟及夏候鸟为主的鸻形目最多，有47种，占目前保护区鸟类总数的44.34%，而鸻形目中的丘鹬科有21种，占保护区鸟类总数的19.81%，是保护区所有鸟类科目中最多种的科目种类，而第二位的鸥科有15种，占保护区鸟类总数的14.15%，其次同样调查到有8种是鸻形目的鸻科，占保护区鸟类总数的7.55%，及7种是鹈形目的鹭科占保护区鸟类总数的6.6%。

观察记录统计数量显示，保护区以鸻科、鹬科、鸥科及鹭科等4科中的鸟类数量最多，其中占保护区所有调查到鸟类数量比率依次是:环颈鸻19.61%、黑腹滨鹬占 18.05%、白鹭占16.8%、白额燕鸥占8.97%、红嘴鸥占7.17%、金斑鸻占4.27%等这6类鸟类是监测到数量最多的种群。从保护级别来看，保护区观察到黑嘴鸥、遗鸥、黄嘴白鹭等国家一级重点保护动物7种，大凤头燕鸥、白琵鹭、翻石鹬、大滨鹬、阔嘴鹬、黑翅鸢等国家二级重点保护动物 14 种。重点保护一二级的鸟类占总监测到鸟类的22.11%。按居留型分析，保护区留鸟 36 种，占33.96%；夏候鸟 14 种，占13.21%；冬候鸟45 种，占 42.45%。同时还首次在泉州沿海区域范围内记录到10多只的大凤头燕鸥在保护区过夏。

监测调查表明，保护区是冬季水鸟重要的迁徒停息地，适宜保留鸟类的生态环境。保护区管理处将继续开展鸟类监测调查，加强生态保护、修复，开展爱鸟护鸟宣传，发动周边群众一起保护环境，维护生物多样性。

△白额燕鸥

△大凤头和白额燕鸥

△大凤头燕鸥

△黑尾鸥

△环颈鸻

△金斑鸻